尽管大家认为应该耐心和宽容。但他们也承认这种缺失说明“基础研究的量上去了，但还没有质的突破”。究竟该怎么做才能让基础研究实现“量变”到“质变”的飞跃？
孙鸿烈院士认为，基础研究有些领域集中度不高，需要在有发展苗头的前沿领域进行由上而下的组织。
陈宜瑜分析说，有些项目原本应该整合在一起研究，但由于受到年度考核等评价指标的影响，存在一些将大课题拆分，以便于分期“交差”的现象。他还举例说，我国某些基础研究领域出现了很好的研究态势，但才露出一点苗头，科研人员就抢发论文，结果反而被其他国家跟踪反超。“可惜的是太急于求成，有时基础研究积淀一下，反而能走得更远，更完美。”
今年国家最高科技奖的获得者、两院院士郑哲敏认为，应该给予基础研究更宽松的环境，能让这个领域充分发挥“自由探索”的精神。