叙利亚新成立的反对派组织“全国联盟”主席哈提卜１９日与埃及外长穆罕默德·卡迈勒·阿姆鲁会谈后表示，“全国联盟”总部将设在埃及。埃及外交部随后发表声明对此消息进行确认：“埃及将在未来向该组织提供一切所需帮助。”19日，叙利亚阿勒颇的武装分子发布视频，宣称拒绝听命于“全国联盟”，并扬言要建伊斯兰国家。美联社称，这一举动表明叙利亚反对派内部的激烈斗争，“事实上，在反对巴沙尔的整个过程中，反对派都一直受困于内部分歧”。
据埃及中东通讯社报道，哈提卜在谈到设立总部时说，“全国联盟”将在10天内在埃及首都开罗召开会议，并听取那些没有加入“全国联盟”的团体的声音。叙利亚“自由军”20日宣布成立自己的情报机构。尽管叙利亚冲突已经持续了20多个月，但此前埃及对叙利亚反对派的支持远不如卡塔尔、沙特、土耳其等国积极。对于埃及此次成为叙利亚新反对派联盟大本营，开罗大学政治学教授哈桑20日对《环球时报》记者说，这表明穆尔西的叙利亚政策正在逐步“前进”。最开始，穆尔西6月底在就职演讲中只是说“叙利亚人民的鲜血不能再流了”；到了8月份，穆尔西在伊斯兰合作组织会议上表示“叙利亚现政权下台的时间到了”；而今又允许叙反对派在埃及“安营扎寨”。哈桑认为，穆尔西希望逊尼派将巴沙尔推翻，这样穆斯林兄弟会就可以在“后巴沙尔时代”获得最大发言权。“穆尔西对待叙利亚问题的态度逐渐强硬，这在根本上是由国家利益所决定的。穆尔西曾对外界表示，我们不反对任何人，但我们要实现自己的国家利益”。
目前，海合会六国以及法国和土耳其都已承认“全国联盟”是叙利亚人民的代表，法国甚至宣布该组织要向法国派驻大使。英国20日宣布正式承认叙利亚“全国联盟”。欧盟19日也宣布“全国联盟”是叙利亚人民的合法代表。意大利19日宣布承认“全国联盟”，但尚不给予外交承认。
虽然得到西方承认，但“全国联盟”在叙利亚国内的权威性却受到挑战。19日，网上出现一段由13个叙利亚激进组织发布的视频。视频显示，20多名武装分子散坐在长桌周围，后面挂着一面黑色旗子，没有表明身份的发言者坐在长桌一头说：“我们是来自阿勒颇及周边地区的武装组织，我们完全拒绝‘全国联盟’的阴谋，我们一致同意要在叙利亚建立伊斯兰国家，拒绝那些总部设在外国的联盟向我们发号施令”。武装分子在视频的最后还高举《古兰经》，称要让其成为叙利亚宪法。据悉，这些激进组织都是活跃在叙利亚前线的武装分子，叙首都大马士革发生的多起爆炸袭击就是由他们制造的，其中有些组织还与“基地”组织有联系。
目前，这段视频的真实性难以确定。据卡塔尔半岛电视台引述上述激进组织发言人的话说，这段视频只是组织内部个别武装人员所为，并不能代表全部人的观点。这段视频也同时遭到叙许多反对派成员的批评，名叫穆罕默德·赛义德的反对派活动人士说：“不管视频是真是假，叙利亚人民都支持‘全国联盟’，我们这周五要在街上举着‘支持叙利亚全国联盟’的标语去游行。”
美国《华尔街日报》20日分析称，反巴沙尔政权的伊斯兰激进组织拒绝承认反对派联盟，对“全国联盟”能否实现自身目标提出了疑问，“‘全国联盟’本想成为一支温和的力量，减弱强硬派极端保守穆斯林的影响，并以此获取外国盟友的资金和武器”。该报分析认为，如果伊斯兰激进组织在反对派联盟之外以其他身份作战，将不利于“协调一致推翻巴沙尔”。