据了解，托管后将由沣渭新区党工委和沣渭新区纪检委全面负责沣渭新区党的工作和纪律检查工作。沣渭新区党工委（纪工委）在托管街道设立派出机构，开展相关工作。设立沣渭新区工会、共青团、妇联组织，负责辖区内工会、共青团和妇联工作。行政管理体制实行管委会-乡镇街办两级行政管理体制。西安沣渭新区管理委员会代表市政府对辖区实施行政管理，管委会通过设立内部机构、派出机构，协调、领导市级行政管理部门在区域内设立的分支机构和托管街道办事处等机构，全面管理辖区经济和社会事务。
这些机构的确立，令沣渭新区在结构上更趋向于政府而非开发区。但沣渭新区方面表示，将加强创新机构设置，实现管理精简高效，按照“大部制”和管委会-街办两级管理模式，推行“小机构、大服务，小政府、大社会”管理；整合资源，提高工作效率。
新的管理体制能给开发建设带来便利，但在托管之后，如何协调“开发区模式”与“行政区模式”之间的关系，“开发区模式”的高效率能否延伸到托管地区，都是摆在沣渭新区面前的考验。另外，新的管理模式是否会带来开发模式的转变？沣渭新区会否走上一条像上海浦东新区、天津滨海新区一样，从城市新区转向真正行政区的道路？这都是社会各界讨论和关注的焦点。
专家观点
地位特殊 可尝试行使更多的社会职能
西安沣渭新区管理委员会为西安市政府派出机构，受省西咸新区建设领导小组和西安市政府双重领导，管理体制和运行机制采取“开发区模式”。
西安人对于“开发区模式”并不陌生，此前成立的“四区一港两基地”对西安的产业及经济发展发挥了强力的带动作用。
但沣渭新区的定位是意义更为广泛的“城市新区”，注重城市功能、配套设施的提升，营造人们生活和产业所需的和谐与便利。
陕西省社科院学术委员会副主任张宝通表示，传统的开发区管委会是经济事务机构，并不承担或只承担一小部分社会事务职能，在处理一些区内事务时会受到其他方面的制约，甚至有些部门出现“扯皮”现象。对沣渭新区而言，这样的模式并不能满足其开发建设的效率需要。
张宝通说，西咸一体化是实施关天经济区战略的关键一环，而沣渭新区处于西咸交汇处，是西咸新区的核心区域。沣渭新区能否建设得顺利、成功，将对关天经济区的构建产生极为重要的影响。特殊的地位决定了其特殊的管理模式，托管方式将使沣渭新区尝试行使更多的社会职能，便于统一开发建设和管理，保持托管街道发展和干部群众利益的整体平衡。
人事制度
运作灵活 有能力的年轻人会成为主力
由于开发区和行政区人事制度的差异，托管地区人员的身份成了社会普遍关注的问题。行政区的工作人员以公务员和事业单位编制为主，而开发区一般采用聘用制，除了部分高层由市政府派出外，其他人员均面向社会招聘，管理、考核上更像企业，末位淘汰、换岗的情况并不少见。此次托管有近3000名在编人员的人事关系转到了沣渭新区。
这次托管有一条重要的原则是人随事走，身份不变。按照《沣渭新区乡镇街道托管及有关管理体制方案》，沣渭新区的人事干部管理体制为：党工委、管委会的工作人员按照开发区体制管理；街道办事处人员的任（聘）用、待遇、考核由沣渭新区党工委、管委会统一组织实施，对各类财政供养人员，保持托管前的身份不变，待遇适当提高。