此后，毛小平行政职务一再被降低，又从正厅级领导干部被降到正处级非领导职务。随着案情查处的进展，2012年2月29日，江苏省委常委会经研究决定，对毛小平予以开除党籍处分。4月5日，中央批示同意江苏省委开除毛小平党籍的决定。
中纪委派专人到江苏督办
据记者了解，毛小平一案是由中纪委直接派专人到江苏省进行督办的。
熟悉纪检监察部门工作的一位人士告诉记者，从毛小平的突然案发和快速查处的情况看，近些年来，纪委查处案件已越来越谨慎，“不像以前一样遇到一些举报时直接(或和被举报者所在单位党委的陪同下)找被举报者谈话，而是不惊动对方，事先由纪委进行调查摸底。”
这种变化，除了在于避免被举报者或被调查者所在单位的党委进行干预外，另一方面也是出于纪委提高办案效率的考虑。纪委直接调查，往往容易查出“窝案”。
鉴于中纪委对毛小平一案进行重点督办，江苏省委书记和省纪委亦高度重视，积极配合。正如江苏省委罗志军所强调的对“违纪犯法者，坚决查处，绝不姑息”，中纪委于2011年12月7日决定对毛小平案进行督办，15天后，毛即被免职。（南方日报）