妇产科分设妇科和产科2个病区。设有独立的门诊、产房、妇科及产科病房，拥有4名高级专业技术职称在内的40余名庞大的医疗队伍。科室常年开展孕妇学校及产前筛查，普及优生、优育知识，消除孕妇高危因素，为生育健康宝宝打下良好基础。2013年实施无痛分娩，不仅减轻产妇痛苦，同时把剖宫产率控制在25%以下。宫腔镜、阴道镜的广泛应用，进一步提高了妇科疾病的诊治水平，宫颈癌、子宫内膜癌等严重妇科肿瘤手术加化疗使众多妇女重获新生。2003年开展了经阴道全子宫切除技术，腹腔镜治疗宫外孕和卵巢囊肿，不开刀，不留疤的优点，大大提高了妇女的手术后生活质量。
儿科是商南县医院床位最多的科室，具有强大的医疗技术团队，科室设有独立的门急诊诊疗区、儿科住院区和洁净的新生儿病区，配备有一大批先进的诊疗设备，可同时满足110名儿童患者的住院需求。该科室管理规范，技术雄厚，医护人员团结协作能力强，发展潜力巨大，已经为全面二孩做好充分准备。
疼痛科是一个具有良好发展潜能的新兴科室，始建于2008年，为商洛市最早成立的疼痛治疗独立科室。该科室开展微创介入治疗技术（靶点射频消融术、臭氧氧化术、胶原酶溶核术）、小针刀松解术、神经阻滞术，配合关节腔冲洗、针灸、推拿、穴位注射等传统治疗方法，对椎间盘突出症、颈椎病、肩周炎、坐骨神经痛、各种关节炎、三叉神经痛等疼痛性疾病疗效显著，其中，微创介入治疗椎间盘突出症1232例，痛苦小、花费少、安全高、疗效显著。
康复科是我县残疾人康复中心，科室设备齐全，环境优美，设有无障碍通道及防滑防跌倒设施，开展物理治疗、运动疗法、作业疗法等综合康复业务，为持证残疾人减免部分治疗费用，是残疾人、急慢性软组织损伤患者最理想的康复基地。
口腔科是我县唯一集口腔综合治疗为一体的现代化科室，开设有口腔内科、口腔颌面外科、牙周病、黏膜病、修复、种植、正畸专业。建有5个标准化诊室，配置先进的口腔综合治疗椅10台，各种设施齐全，医疗技术一流，可熟练开展种植牙、烤瓷牙、全口牙修复、牙体牙髓病、牙周病、牙根病、错颌畸形的治疗，口腔颌面颈部外伤、骨折、肿瘤及整形治疗技术处于全市先进水平。
眼科是商洛市优势医疗转科，拥有进口手术显微镜、角膜屈光仪、眼科专用A∕B超检查仪、非接触式眼压计等先进的医疗设备，年开展复杂病例白内障手术、青光眼白内障联合手术、眼眶肿瘤摘除术、义眼胎植入术等高难度眼科手术500余例。近期采用微切口白内障摘除折叠晶体植入术，痛苦小、疗效好，为我县防盲治盲工作提供了坚强有力的技术保障。
耳鼻喉科拥有耳鼻咽喉内窥镜系统3套，丹麦进口纯音听阈测听仪、中耳分析仪；德国耳科手术显微镜配套设备。开展改良乳突根治术、鼓膜修补术、鼻（鼻窦）肿瘤摘除术等一批三级医院治疗手术，处于市内领先水平。近年还开展离子射频腺样体切除术、扁桃体剥离呼吸机治疗鼾症疗效显著，深受鼾症患者赞誉。
点击查看原始图片
急救站急诊科是集院前急救、院内抢救为一体的急危重症患者集体，配备完善的院前急救单元4个，负责全天候院前院内急救任务。该科室人员年富力强，踏实肯干，年出车抢救2000余次，深受社会好评。院内急诊拥有心肺复苏机、除颤仪、呼吸机、监护仪等完善抢救设备，承担着全县各种危急重症患者医疗救治及各种突发公共卫生事件应急救援，对心肺复苏、急性中毒、心血管急症抢救积累了丰富经验。
大理念营造人性化的就医环境，彰显陕南医疗服务特色
新医院以人为本，建设一流的住院设施。候诊大厅宽敞明亮、快捷方便；标识醒目，设施齐全；各病房设有独立卫生间、淋浴设施和中央空调；设有VIP病房和VIP诊室；住院楼整栋备有8部电梯，四部应急疏散楼梯；楼内一系列现代化安防系统为患者的安全提供强有力的保障。农行、农村商业银行设置的24小时自助银行为百姓提供更加高效的就医条件。医院中心医疗区采用“无缝式”、“流水型”设计，将挂号、收费、门诊、检查、住院、取药等科室的设置与患者入院流程相结合，使门诊楼、医技楼、住院楼相通相连，让来院患者充分感受到“一条龙”式服务。