在保护利用的同时,兰科中心对兰科植物濒危机制的研究也迅速扬名国际。2006年,兰科中心的《一个兰花的自花授精策略》揭示了一种全新的植物繁衍系统与生物进化模式,在生命科学及进化生物学上具有深远意义。这一重大成果发表在国际顶级科技期刊《自然》杂志上,实现了深圳市在该杂志发表科研成果零的突破,同时被《大英百科全书》认定为全世界六项重大突破之一,该成果被世界动植物界认定为推进了达尔文的研究。
此外,《长瓣杓兰种群数量动态与生殖行为的相关性》《疣花三角兰的生殖策略》等三项科研成果,被《自然》杂志选为优秀成果,并在《自然中国》杂志上进行重点推介。兰科中心还出版了《中国兜兰属植物》等10部研究专着,出版兰科专着数量为全国之最。