经过１８天的航程，搭载“蛟龙”号的“向阳红０９”母船于当地时间６日晨抵达位于东北太平洋的中国多金属结核勘探合同区，开始第二航段作业。科考队在为预定７日的“蛟龙”下潜进行“热身”准备。
现场指挥部初步决定，“蛟龙”号将在当地时间７日７时（北京时间８日１时）进行第二航段首次下潜，下潜深度约为５２００米。这将是“蛟龙”号自２００９年以来进行的第６３次下潜。
本次下潜的位置在夏威夷东南方５００多海里处，“向阳红０９”船停留的具体坐标是北纬１０度０１分，西经１５４度１８分。这是我国享有专属勘探权和优先开采权的多金属结核勘探合同区，在这个７．５万平方公里的合同区里，锰、铜、钴、镍等金属结核的丰度和品位较高。
根据科考队的日程表，在这个合同区内有１０至１２天的作业时间，其间将进行５次预定下潜和２次机动下潜。
“１１日之前的海况都还可以，我们要抓紧这个时间窗口，把几次下潜搞好。”现场总指挥刘峰在船一到位就立即到前甲板巡视，表示对海况还比较满意。
记者从国家海洋环境预报中心随船气象员孙虎林处获知，当地海域在今明两天的天气是多云有阵雨，东到东南风４到５级，浪高１．５到２．０米，到７日下午转东到东北风４到５级，短时阵风６级。这都属于三、四级海况，而“蛟龙”号可以在五级海况以下作业，天气条件满足下潜需求。
天时、地利均已具备，科考队也展现各司其职的“人和”，为下潜进行准备：副总指挥、安全总监李向阳叮嘱大家戴安全帽穿防滑鞋；潜航员召集所有计划下潜人员宣读深潜作业规程；调查仪器保障员王友亮用不同材料的小卡片做防腐试验；水面支持系统技术人员高伟、李德威有条不紊地操作ＣＴＤ绞车，为“蛟龙”下潜先探个路。
“ＣＴＤ是重要的常规调查设备，用来测量作业海区海水的温度、盐度和深度。对‘蛟龙’号还有特别的作用，就是根据这些参数计算潜水器下潜和上浮所需的压载配重。”现场副总指挥、水面支持系统负责人丁忠军介绍说。
ＣＴＤ设备下到５０００米海深，获得声速剖面数据后回收至甲板，随后开始布放用于潜水器水下定位的长基线信标。
对于即将开始的第二航段“蛟龙”探海，深潜部门负责人叶聪说：“下潜作业分为工程下潜、应用下潜和培训下潜。７日的首次下潜是工程下潜，目的是检验潜水器的性能。其后几次都是应用下潜，由潜航员、工程技术人员和科学家共同完成。”
本次“蛟龙”号试验性应用航次分３个航段共计１１３天，在圆满完成位于南海的第一航段任务后，搭载“蛟龙”号的“向阳红０９”母船于７月１９日从厦门起航，经过５２８１海里的航行，６日抵达了第二航段作业区。这次航行时间达１８天，超过了“向阳红０９”船２０１１年搭载“蛟龙”号从江阴出发到本海区进行海试前航行１４天的纪录。