这种反现代的论调，与本·拉丹如出一辙。
组织者而非领导者？
2001年9·11事件后，美国人对本·拉丹和扎瓦赫里的藏身之处进行了密集轰炸。当地面部队到达时，他们发现超过一百具尸体，据美国联邦调查局称，扎瓦赫里的妻子和孩子也在这次轰炸中丧生。
有一盘录像带显示，本·拉丹和扎瓦赫里坐在山中溪畔的毛毯上，谈论“圣战”组织的9·11行动。苍白的本·拉丹说得不多，扎瓦赫里缠了条黑色的头巾，他可能还在为家人的死致哀，但他看起来状态不错。“这个伟大的胜利只可能来自真主的恩宠，”他用安静又骄傲的语调说道，“这不仅是一个人的成就——它是‘圣战’行动。”
现在，本·拉丹死了，世界都在关心：基地组织何去何从？扎瓦赫里藏在哪里？
扎瓦赫里的行踪还无人知晓。但较为普遍的猜测是，他躲在巴基斯坦。扎瓦赫里行事谨慎，掌握他的行踪并不是件容易的事。他对组织内部，甚至家人都不会透露自己的行动，有时还常常制造烟幕弹，提供虚假的行动计划。
反恐专家表示，从战略上说，杀死“圣战”组织的支持者远比消灭思想容易。基地组织的思想，会跟创造它的可怕的政治、社会环境存在得一样长久。
即使扎瓦赫里能逃过美军的追捕，他领导下的基地组织，也极可能面临重重阻碍。一个首要的问题是，他是否能继续鼓舞新一代的“圣战”战士，能否维持本·拉丹追随者的忠诚。
《纽约客》杂志记者劳伦斯·赖特曾在接受采访时表示：本·拉丹和扎瓦赫里各取所需，谁也少不了谁。本·拉丹虽然有一套伊斯兰的理论，但缺乏日常事务管理的经验。而扎瓦赫里正好可以弥补这一点。他先前在埃及的经历，让其擅长于运作地下组织。不过，人们愿意为本·拉丹献身，对他却不见得。他是个好的组织者，却不是个天生的领导人，何况，本·拉丹很有钱，可以赞助因多年的游击战争濒临破产的埃及“圣战”组织。
美国《商业周刊》也发文指出，扎瓦赫里更像一个组织者，而不是像本·拉丹那样鼓舞人心的角色。据《纽约客》报道，扎瓦赫里的一名同伴，坦克指挥官Isamal-Qamari曾直接告诉他：“无论你属于什么团体，你不能当它的领导。”这名颇具霸气的指挥官认为，扎瓦赫里恰恰缺少自己这种气质。
个人的性格只是问题之一。本·拉丹死后，扎瓦赫里努力贩卖基地组织思想，想以此解决中东目前面临的种种问题。在2011年1月至4月间，扎瓦赫里5次公布了录音，它们被翻译后发布在Jihadology网站上。在讲话中，他试图将横扫阿拉伯世界的起义，归因于9·11袭击后，鼓舞伊斯兰“圣战”。他还号召在埃及建立一个伊斯兰教王国，并批评道：“那些要取悦美国的人，会在你们当中散布偷情、纵酒、道德败坏、家庭分裂以及一切形式的犯罪。”
但组织阿拉伯世界起义的年轻人，强调的是和平、民主，对建立伊斯兰王国兴趣不大。“‘圣战’组织思想的基础，是这样一个论点：‘圣战’是带来改变的唯一途径，”跟踪伊斯兰极端组织数十年的沙特阿拉伯记者JAMALKHASHOGGI说，“Facebook在这点上比‘圣战’组织做得更好。”