近年来，商洛突出抓项目、建机制、强措施、严监管，全力推进丹江等流域水污染防工作。2013年至今，全市累计完成投资30.93亿元，共实施丹江等流域污染防治项目311个。7县区全部建成污水和垃圾处理厂，城市污水处理率89.15%、垃圾处理率96.22%。目前，全市10个城市饮用水源保护区水质达标率100%。辖区丹江、洛河、金钱河、银花河、乾佑河等9条主要河流20个监测断面水质全部达到功能区标准，丹江出境断面水质稳定达到Ⅱ类。为确保“一江清水供京津”做出了积极贡献。
编制工作方案，全面安排部署。先后制定出台了《商洛市丹江等流域污染防治工作三年行动计划(2013-2016年)》《商洛市水污染防治工作实施方案》等，策划了工业废水治理及重金属污染防治、畜禽养殖污染治理、镇村污水垃圾处置设施建设等8大类208个项目，在全省率先实施了丹江等流域三年行动计划。召开了商洛市丹江等流域污染防治工作三年行动计划动员大会，对防治工作进行全面部署，成立了丹江等流域污染防治工作领导小组等组织机构，落实了各县区政府和相关部门的治污责任。
完善工作机制，强力推进治污。健全完善丹江等流域污染防治河长制、目标责任制、联席会议制度、出境断面水质月通报制度、媒体曝光制度等一系列规章制度，积极组织开展污染治理，确保水质安全。同时，坚持每月对丹江流域出境断面水质实行监测通报，对各县区丹江等流域污染防治项目实施进展情况进行月通报，并在《商洛日报》上进行公示排名，督促推动丹江等流域污染防治工作的开展。按照《商洛市城市饮用水安全信息公开方案的通知》要求，及时向社会公布了我市中心城市在用集中式生活饮用水季度安全状况信息。
开展明察暗访，曝光偷排乱排。为了彻底杜绝丹江沿岸河边私设排污口、生活垃圾乱倒、企业偷排乱排污水，市环保局成立明查暗访组，坚持每季度深入7县区厂矿企业、城镇和农村社区对污水垃圾等环境问题进行暗访拍摄曝光，并将拍摄的视频镜头送市政府领导，组织市直部门、各县区政府主要领导观看，督促县区采取治理措施，改善区域环境。
严格执法检查，强化环境监管。在环境执法工作中，坚持日常巡查和不定期抽查相结合，强化环境监管力度，全市6县1区环境监管网格化管理全覆盖。严把项目审批关，严格执行环境影响评价和“三同时”制度，从源头控制新污染源产生。严格实施总量控制，对于不能满足总量控制要求、不能实现达标排放、不符合产业政策或规划布局要求的建设项目坚决不批。
实施生态创建，淘汰落后产能。以“面上不见垃圾污水”为目标，以生态创建为载体，以镇村垃圾污水收集处置、饮用水源保护和畜禽养殖污染治理为重点，扎实开展农村“清洁工程”，深入推进生态县、生态镇、生态村创建。同时，积极推进清洁生产审核，以创建“绿色企业”为载体，继续在重点行业、工业园区和企业推行清洁生产审核，实现节能、降耗、减污、增效的目标。
强化应急管理，确保水质安全。成立了环境应急与事故调查中心，组建了应急处置队伍。修订了《商洛市环境突发事件应急预案》，编制了《危险化学品及重金属突发环境事件处置手册》和《丹江等流域突发环境事件应急工程规划技术方案》;印发了《关于进一步加强危化品车辆运输等突发环境事件应急处置工作的通知》;建立了应急物资储备中心，在丹江沿线河道修建了环境应急工程。组织举办了全省尾矿库环境应急演练现场会，迅速、科学、妥善处置了数起突发环境事件。
加强环境宣传，营造舆论氛围。围绕丹江等流域水污染防治等环保重点工作，依托《商洛日报》、商洛电视台建立了“环保周刊”“环保在行动”一周一刊一播宣传长效机制;开通了官方微信、微博，加强新兴媒体宣传;积极开展“6·5”世界环境日系列宣传活动，深入开展“最美环保人”评选、环保摄影展、“十百千万”环保在行动倍增计划等宣传活动。积极营造了丹江等流域污染防治和水源涵养地环境保护工作的良好社会氛围。