达尔文在《物种起源》一书中比较多地推崇自然选择，认为生物进化中有害的突变比较多，有利的突变很少，而经过长期的进化过程，有利的突变经过自然选择终于占了上风。
但后来科学研究发现，物种的有害突变和有利突变都不是很多，多的是对于自然选择来说不好也不坏的中性突变，这后一类突变与进化的关联还有待深入细致的研究。
《物种起源》特意回避人类的进化问题
据新华社电书籍是人类进步的阶梯，150年前出版的《物种起源》则帮助人类登上了一个高高的台阶。而从高处回望，还可以看见位于《物种起源》之下的层层叠叠的书籍阶梯。
受多位学者启发
最早的一块奠基石，可以追溯到2300多年前古希腊的亚里士多德。后来，又有人提出了各种各样的进化学说。其中一个重要的台阶无疑是拉马克的“用进废退”学说，尤其巧合的是1809年他的著作《动物的哲学》出版，正好是达尔文出生那一年。
不过，和《物种起源》的诞生联系最为紧密的也许是以下几本。1831年，达尔文开始环球航行时，随身携带了一本英国地质学家莱尔刚刚出版的《地质学原理》。结束环球考察回到英国后，达尔文又认真阅读了马尔萨斯的著作《人口论》。书中对人口过度增长而生存空间有限的论述，直接启发达尔文提出在自然选择下适者生存的进化学说。还有一本书堪称“铺路石”，就是1844年在英国出版的匿名读物《自然创造史的遗迹》。
后来便是众所周知的英国青年科学家华莱士在1858年给达尔文寄来的论文，文中提到前者对进化论的独立思考，其理论与达尔文十分相似。
1859年11月24日，达尔文比原计划提前出版了《物种起源》一书，他当时觉得这不过是构思中鸿篇巨制的“摘要”，这从最初他所拟书名《通过自然选择物种起源的论文摘要》就可看出。后来经与出版商协商，删掉了“摘要”一词，其书名简称为《物种起源》。
曾回避人的进化问题
达尔文在《物种起源》中小心翼翼地避开了一个关键问题：人是否也像其他动物一样是通过自然选择进化而来的呢？如果承认这一点，势必完全推翻“神创论”，对当时的宗教和社会造成革命性冲击，这正是达尔文谨慎的原因。
1871年，他出版了另一本论述人类起源的重要著作，全面利用进化思想解释了人类的起源问题，为帮助科学最终彻底冲破“神创论”的束缚作出了重大贡献。
达尔文进化论主要观点
1859年11月24日，达尔文的《物种起源》一书出版。这本书极大地冲击了“神创论”，引起教会激烈反对，但也得到许多有识之士的赞赏和维护。此后，达尔文的学说在全球广泛传播，不断深入人心。19世纪70年代，达尔文的学说传入中国。
《物种起源》系统阐述了进化论思想：第一，一般进化论。物种是可变的，现有物种由别的物种演变而来，一个物种可以变成新物种，这是已被科学界普遍认可的观点。第二，共同祖先说。目前，分子生物学已发现所有生物都使用同一套遗传密码。第三，自然选择说。第四，渐变论，即物种是通过微小的优势变异逐渐改进的。