动物演员被训练、挑选出来后，如何拍戏依然是最大问题，这时候就要看导演的安排、调度了。阿诺就与狼进行了斗智斗勇：比如，他让剧组在假血里掺杂狼喜欢的味道，嗅觉灵敏的它们就会过来舔舐和打滚；利用汽笛声引发条件反射，让它们跑向声源，然后给予食物奖励；训练它们追逐装有摄影器材的汽车，以此拍摄狼奔跑中的近景。而在拍摄群狼偷袭羊圈的那场戏时，则需要两组驯兽师大声呼叫狼演员的昵称，并且用特殊的鸣笛、口号、指令加以辅助，引导数只蒙古狼翻越羊圈。拍摄狼被困在火山口里，剧组搭建了好几公里长的护栏，为的是让狼感到不被禁锢，又不让它们跑散。那场暴风雪之夜200匹马对35匹狼的史诗级场面，则完全采用真马、真狼、真夜景、真暴风雪，7分钟的段落一共拍了48天。给狼说戏对于阿诺来说很有挑战，但是难不倒他，毕竟他以往拍摄过《熊的故事》和《虎兄虎弟》，有与动物打交道的丰富经历。
不过，尽管进行了充足的准备，与动物演戏还是会有意外发生。《狼图腾》拍摄时，剧组会在现场拉起防护栅栏和防护电网，更有专业团队随时保持警惕。尽管如此，冯绍峰还是被狼抓伤。
难：狼明星难伺候，拍一小时就得休息
得：为如何保护动物演员树立标杆
以往，国内的影视剧从业人员对于动物保护的意识并不浓厚，伤害甚至杀害动物的事件时有发生。如今，随着人们动物保护意识的加强，动物演员们也开始受到特别呵护，甚至其待遇要超过真人明星。李安导演曾经在接受记者采访时谈到过自己如何在动物保护组织的“监督”下，小心翼翼地伺候《少年派》中的几位老虎演员。李安称在剧组里，老虎住的地方堪比五星级宾馆，动物保护组织的相关人士会来片场“探班”，剧组也要随时写报告给动物组织，进行汇报。
而在《狼图腾》里，所有的动物也都被尽量地保护起来。中影人士介绍，狼演员们是剧组大腕，通常都是剧组工作人员做好一切准备，真人演员就位后，驯兽师检查没有问题，才会让狼演员出场。而且，剧组成员每天要连续忙碌十几小时，而狼的工作时间十分严格，每隔一小时就得休息。
剧情中不乏狼对羊或者马匹的追猎、厮杀场面，如何在保证拍摄效果的情况下，不会对动物进行真的伤害？对此，中影人士解释道：“狼在猎马时一般先咬住马尾，让马失去重心摔在地上。于是，在拍摄时，剧组将一个假的马尾装在马背上，并把马放上小拖车，这样被狼攻击后不会跌落受伤。马被咬住时会扬蹄反击，为了不伤害狼，剧组又使用假马腿等道具。这些镜头都是一闪而过，观众不会觉察到破绽。”