2007年4月，国防部长谢尔久科夫将马卡罗夫重新召回莫斯科，出任武装力量装备部部长兼国防部副部长。在担任装备部长期间，马卡罗夫积极策划对俄军进行大刀阔斧式的改革，这与谢尔久科夫为俄军设计的改革方案一拍即合，因此很快成为谢尔久科夫的得力助手。2008年6月3日，在谢尔久科夫举荐下，马卡罗夫成为俄军总参谋部的新掌门人。
尽管马卡罗夫对推行“精兵简政”颇有信心，但军中对其质疑之声却不绝于耳。从2008年起，有多位将军因对改革举措不满，主动递交辞呈。事实上，俄军中对马卡罗夫军队改革的质疑早已有之。一名俄军高官甚至还指出，马卡罗夫执掌总参谋部后，俄罗斯武装力量始终处于一种临时过渡状态——基本规章和战斗条令迟迟不能出台，各军兵种编制机构和驻地部署方案也无法敲定，这一切导致军队的瘫痪和战斗力的丧失。“总参谋长总喜欢提及部队‘神奇’的战斗力，其实都是在虚张声势。”
不过，目前有一点是可以肯定的——已确定未来六年执掌克里姆林宫的普京仍然信任马卡罗夫，他的改革举措也仍将持续下去，因为俄武装力量并没有回头路可走。(新华网)