2001年,金章洙外放为韩国陆军第7军军长,两年后再次“回流”联合参谋本部。2005年4月,金章洙出任韩国陆军第37任总参谋长。次年11月,他被时任总统的卢武炫提拔为韩国第40任国防部长。
2008年2月,金章洙以美韩联合司令部副司令的身份退役,并于同年加入李明博总统所在的大国家党(即如今的新国家党)。他对该党新崛起的新星朴槿惠非常看好,不遗余力地为其打开与军队高层的交往渠道。
在当前朝鲜半岛危机持续升级的背景下,朴槿惠之所以重用军人出身的金章洙还有一个重要原因,那就是他与平壤之间有着某种历史联系。据称,2007年11月27日,时任韩国国防部长的金章洙随总统卢武铉飞抵平壤,参加了朝韩国防部长级会谈,并曾与当时的朝鲜最高领导人会面。在那次首脑会谈中,因与朝鲜领导人礼节性握手时没有低头,显得颇为“傲气”,金章洙居然由此在国内获得了“强硬将军”的别称。对此,金章洙在五年后向韩国记者解释说,“我跟人握手的时候本来就没有低头的习惯,况且我作为统帅60万国军的国防部长,怎么能向对方低头呢?”
有分析称,朴槿惠可能有意通过任用金章洙等强硬派,向外界传递一个信息,那就是韩国决心对朝鲜实施“强力应对”。同样,作为精通处理韩美关系的军方大佬,金章洙或许也将在韩美共同应对朝核危机时发挥关键作用,只是这种作用将把朝鲜半岛的局势引向何方,目前还难定论。