作为第四代防空反导武器系统，极其关键的一点是具备拦截来袭的高速、机动飞行的弹道导弹和巡航导弹的能力。在这一点上，美国率先使用KKV技术。该技术使拦截弹能以直接碰撞的方式击毁来袭的导弹。KKV技术关键是导弹前端有一系列微型脉冲发动机，它能控制燃气舵（观察者网注：原文如此，疑应为“配合燃气舵”），使导弹在向前飞行的同时做快速、机动的侧向运动（技术术语叫“导弹推力矢量控制”），这项技术代表当今地面防空领域精确制导技术应用的国际最高水平。再者是采用主动雷达寻的制导体制（即引导头主动寻找目标，实现“发射后不管”）。KKV到底哪首先在“爱国者”PAC-3系统中应用，成效显著。随后美海军将“宙斯盾”舰上配备的“标准”2换成具备KKV技术的“标准”3舰空导弹，同时，相控阵雷达SPY-1没做实质性的改进，而整个系统具备较强的反导能力，被称为“宙斯盾弹道导弹防御系统”。
根据俄罗斯原来的规划方案，S-400可配备三种导弹：其中40N6导弹飞行高度达70千米，采用二次点火技术，飞行距离可达400千米，是当今射程最远的地空导弹。同时地面配备一台作用距离达600千米的超市距雷达作目标指示。不过值得注意的是，俄罗斯的官方表态是：40N6导弹主要拦截视距外至400千米范围内的敌方预警机和电子战飞机等大、中型目标；用以瓦解敌方的“占去外攻击战术”（即“雷达视距外攻击战术”）。而国内外有些媒体却误读为在此范围内S-400具备拦截各种弹道导弹的能力。
至于S-400的中近程拦截任务，则用机动性较好的9M96系列导弹，并保留S-300原用的48N6导弹。9M96系列弹的弹体为鸭式布局，具有推力矢量控制，可在35千米高空作变轨飞行。其中9M96E弹用于近程40千米内拦截；9M96E2弹用于中程120千米内拦截。40N6和9M96这两系列导弹的战斗部都采用定向破片爆炸，以增加杀伤力；二者都采用主动引导头。由此可以说，如果S-400配备齐全的话，俄美两家的第四代防空反导武器称得上是各有绝招，旗鼓相当。
另外，根据俄罗斯S-400的规划方案，S-400还有一大亮点是配备一部米波数字化相控阵雷达。此雷达采用庞大的二维对数周期天线，据信可探测600千米外雷达反射面积小于0.0065平方米的隐身目标，将是当今世界上唯一用于地空导弹系统的米波雷达。俄罗斯还宣称，米波、微波雷达配合使用，将成为俄反导系统的基本格局。
俄官方媒体一再宣称：“一套S-400可替代3套S-300，在目标命中率和攻击速度方面比S-300提高一倍；抗干扰能力提高4倍；它装备40N6远程导弹，作战距离400千米以上，是当今射程最远的地空导弹；还可装备9M96E2和48N6E2、E3两种系列的中近程导弹，实现中低层反导。因此可以说S-400具备拦截高度在30千米以下，速度在4.8千米/秒以下包括飞机、巡航和弹道战术导弹在内的各种来袭武器的能力”，“可与美国最先进的‘爱国者’PAC-3相媲美”等。近来，随着普京批准向中国出口S-400，媒体紧跟着宣传：“中国配备S-400后，可覆盖离海岸300千米的钓鱼岛……”