话说，元璋做了皇帝以后，随他征战多年的淮西老乡也纷纷鸡犬升天，位列朝堂之上。洪武四年(1371)论功行赏，共封六公二十八侯，其中淮人占据三十一席，淮西帮权势熏天。相形之下，即便是那位常被元璋誉为“吾之子房”的刘伯温也不过爵封“诚意伯”而已。
明朝建立伊始，中央承袭元朝旧制，设中书省综理机务，由左右丞相负责，又以左为尊，位列百官之首。在胡惟庸之前，李善长小心谨慎，为相四年后退休；徐达常年征战在外，挂名而已；汪广洋喜好饮酒作诗，只图自保，唯唯诺诺，看胡惟庸脸色行事，却依旧被淮西帮排挤出朝，构陷致死。唯有胡惟庸，作为李善长之后的淮西帮领袖，居相位达七年之久。然而，位极人臣的胡惟庸脑子发热，犯了为官大忌：身为奴才却独揽大权，骄横跋扈不知检点，抢了主子的风头。这令权欲颇重、猜忌好杀的领袖十分忌恨。
相权的膨胀引起了皇帝的狂躁不安，遂指使检校(特务)罗织罪名，以“擅权植党”的罪名干掉了胡惟庸，同时将与胡来往密切的官员抄家灭族，之后屡兴大狱，使得“胡案”不断牵连扩大，一直杀到洪武二十三年(1390)，将早已退休在家的李善长以谋反罪名被灭族之后才告一段落。
此次大清洗，开国元勋被诛杀大半，共有三万余人身首异处，流放充军者不计其数。不难看出，绰号“百官之首”的丞相在皇帝的面前是如何不堪一击，相权对皇权的所谓制约作用实在是浪得虚名。
朱元璋趁此机会撤销中书省，废除丞相制度，总揽大小事务，并于洪武二十八年(1395)昭告天下，将该决议写入《皇明祖训》(虽为家法，但如同宪法大纲)，永为定制，后世臣子若有妄言恢复者，杀无赦。此举将朱元璋杀戮功臣的终极目的暴露无遗。
杀人如麻的父亲，使得主张以宽治国的朱标无法容忍，斗胆劝谏说：陛下杀人过滥，恐伤和气。
元璋愠怒，莫不吱声。
第二天，朱标入宫请安，元璋命他将提前放在地上的一根长满利刺的棘杖捡起来，朱标面有难色。元璋开始训诫：
“你怕有刺而不敢拿，朕将这些刺儿统统去除之后再交给你，岂不更好？朕所诛杀的全是天下的恶人，屋里收拾干净了，你才好当这个家，老子这是为你好，明白了吗？”
朱标不以为然地嘀咕道：“上有尧舜之君，下有尧舜之民。”
这句话的本意是说上有仁君，下有良民。放到这里显然是讥讽暴虐的皇帝只会生出暴虐的臣民。元璋勃然大怒，拎起椅子就朝朱标砸去。谁知，朱标练过凌波微步，致使元璋一击未中，元璋捡起椅子继续追打。情急之下，朱标只好使出了自己的撒手锏，奔跑途中，刻意将藏在袖中的母亲画像掉在了地上。元璋一看见糟糠之妻的遗像，顿时蔫了。想起了往日夫妻之间的点点滴滴，也想起了老婆当初劝他善待儿子的话语，于是站在那里一动不动，眼泪簌簌地流了下来。朱标因此逃过一劫。
俗话说“妻以夫贵”，但朱元璋的早年却是绝对的“夫以妻贵”。投奔红军头目郭子兴时，他不仅一贫如洗，且相貌极其丑陋。后仗着作战勇猛和脑子好使，逐渐受到了领导的青睐，郭子兴竟将义女马氏许配与他。自此，重八(朱元璋本名)地位上升，众人不再称其绰号“朱老八”而改称其为“朱公子”。后来，子兴病死，余部逐渐由“朱公子”掌控，成为日后称霸东南，问鼎中原的基干力量。马氏虽和丈夫一样，文化水平不高，但却是位颇识大体的贤妻良母。她不仅辅助丈夫，艰苦创业，而且关爱子女，体谅臣下，经常充当君臣父子矛盾的缓冲人，挽救过多人性命。
洪武十五年(1382)八月，马皇后病逝，元璋悲痛不已，感念夫妻情深，遂不再立后。然而，朱标深感与父亲矛盾日深，常常内不自安，愈加思念母亲。为防不测，他就把母亲的画像随身携带。危急时刻，果真派上了用场。