洪武二十四年(1391)八月，朱标奉命巡视陕西。此次出行，他肩负着两项使命，一是核实二弟朱樉的诸多不法行为是否属实；二是考察关中地区是否适宜建都。
年初，秦王朱樉在封国内的斑斑劣迹被人告发，大致如下：
母丧期间，毫无一丝的忧伤之色；偏信侧妃邓氏(宁河王邓愈之女)之言，虐待并囚禁正妻王氏(元朝河南王王保保之妹)；公然强抢民妇，纵欲无度；发明种种酷刑，虐杀宫人。
元璋震怒，感慨道：“古所未有，罪不容诛！”
另外一个就是建都问题。此前，元璋已经钦定应天府为南京，开封府为北京，故乡濠州为中都。然而，他似乎对于以上三地都不太满意，仍然在考虑着更好的立都之处。胡子祺上书阐述了关中地区最为适宜建都的几条理由。他觉得很有道理，于是派朱标赴关中考察山川地貌和风土人情，转达最高领袖慰问三秦百姓的圣意。
关中之行，倒算顺利，可死神却已向朱标招手。
回京不久，朱标得知父皇要将罪名属实的二弟朱樉处以极刑，遂奔赴宫中求情。尚未步入大殿，朱标就高声喊道：
“不要杀啊，皇帝爸爸，求您放了二弟。”
元璋郑重地说道：“今天朕要替天行道！”
朱标跪求：“皇帝爸爸，手下留情啊！试问人谁无过，他总算是我的弟弟，弟弟有错，做兄长的也有责任，求皇帝爸爸放他一条生路吧！”
元璋声色俱厉：“朕不消灭他，无法向全国人民交代。”
朱标呜咽：“儿臣不会使您为难的，请皇帝爸爸跟全国人民说一声，儿臣愿意一命抵一命。”
元璋大惊失色：“啊？”
朱标哭泣道：“正所谓，吾不入地狱，谁入地狱，求爸爸您体谅。我这样做，无非是想感化二弟，以彰显吾皇慈悲的伟大公正形象啊！”
元璋敛容：“善哉，善哉，朱樉，希望你有一天能够领悟到你大哥这种舍生取义的精神！”
经过朱标的苦苦哀求，元璋终于人性大发，放过了朱樉，准许其返回藩国。二弟得救了，朱标却病倒了。
由于他长期生活在魔鬼父亲为他营造的压抑而恐惧的环境当中，身心健康受到极大的摧残。从西安回来后，旅途的劳顿，外加精神的刺激，更由于长期的高度紧张、惊恐和郁闷得不到排解，终于导致了此次疾病的总爆发。
养病期间，心忧社稷的朱标还将考察团绘制的陕西地图呈上，并多次汇报出行期间的见闻，以及对于定都的看法。可无情的病魔终究吞噬了他的生命。
次年四月，在与病魔顽强抗争了N天之后，朱标的病情突然恶化，最终医治无效，逝世于南京。满朝文武和全国人民无不为失去这位好太子而感到深切悲痛。朱标的英年早逝，对于伟大领袖朱元璋，对于朝野上下，对于大明朝未竟的各项建设事业，都是巨大的损失。他尚未尝到做皇帝的滋味，便匆匆走完了他尊贵而郁闷的一生，享年三十七岁。悲哀，实在是悲哀！
二十多年的悉心培养付之东流，白发人送了黑发人，怎能不令老年丧子的元璋悲痛欲绝。朱标死去多日后，思子心切的老皇帝依旧穿着丧衣，迟迟不忍脱去。
八月，朱标被葬于孝陵东侧，谥号“懿文”。原来，文章开头部分提到的那座陵墓的主人就是这位可怜的懿文太子。（中新网）