相对于射频消融治疗来说，微波消融还具有更多理论上的优势。如微波可以用于各种组织肿瘤的治疗，在对组织的加热过程中，它不会受到电阻和传导性的影响和制约。微波可以使组织温度升得更快、更高，这也意味着手术时间更短、更安全。相对于射频，电磁波能量可以解决血流的冷却效应问题，对靠近血管的肿瘤也有很好的热效应。但是与射频消融相比较，微波治疗的范围不易精确调节。
冷冻治疗准确性高
冷冻技术同样是通过工作探针刺入肿瘤内部，但其是通过低温冷冻系统使组织细胞降温，导致肿瘤细胞脱水、破裂。同时冷冻还可以使微血管收缩、血流缓慢、微血栓形成，从而导致血流受阻、肿瘤组织缺血坏死。被破坏的细胞作为抗原，还可以刺激机体产生抗体，提高免疫能力。对于使细胞坏死、蛋白变性来说，至少要低于-40℃的低温才可以起到治疗作用。
相对于微波和射频消融治疗，在冷冻时可以应用影像检查实时监控冷冻作用范围，使冷冻作用的范围超过肿瘤边缘1 厘米，从而收到确切的治疗效果。而微波和射频消融治疗肿瘤与正常组织之间没有明显的对比。
根据目前的研究，相同情况的肾脏肿瘤患者，三者的治疗效果均与保留肾单位的手术治疗相似。总体来说，能量消融治疗肾脏肿瘤除适用于因心、肺、肝等功能较差不能耐受外科手术的患者，以及晚期肿瘤、肾癌术后复发及转移的姑息治疗，还特别适用于双侧肾癌、孤立肾肾癌、肾功能不全的肾癌、移植肾肾癌、遗传性肾癌，以及曾行肾部分或根治性肾切除的肾癌患者，对于最大直径小于8 厘米（尤其是小肾癌，直径小于4 厘米）、无远处转移及肾静脉瘤栓形成的肾癌患者，也可以采用该类方法治疗。