最后，加强保密措施和欺骗手段。偷袭计划严格保密，在1941年10月前知道偷袭计划的，只有联合舰队司令山本五十六大将，联合舰队参谋长福留繁少将，第十一航空舰队参谋长大西泷次郎少将，第一航空舰队参谋长草鹿龙之介少将等极少数参与策划、研究、制定计划的高级将领。联合舰队与海军军令部之间有关该计划一切交涉，都是在绝对保密下进行的。制定计划时有关图上作业，均指定相关人员，在规定地点严格保密情况下进行。直到10月后，出于战备的需要，才向担负偷袭任务的第一航空舰队所属舰队司令、参谋、航空母舰舰长和航母的航空部门长、飞行队长传达与各自职务相关的有关部分。战前训练同样严格保密，1941年8月起参战部队开始进行针对性极强的战前训练，所有参训的人员都只知道训练的要求和标准，根本不知道训练的目的是什么。训练地点安排在日本南部九州的鹿儿岛和佐伯湾，而部队集结地点则在日本北部的择捉岛单冠湾。部队集结严格保密，11月16日起，参战部队以“木户部队”为代号开始向单冠湾集结，各舰在集结过程中，收发报机一律加上铅封，实行严格的无线电静默。各舰在向单冠湾航行途中，都选择远离一般商船航线的偏僻航线，而且分别按不同航线、不规则时间间隔前往，有的先西后东，取道日本海；有的先南后北，取道小笠原群岛。集结行动计划也严格保密，只下发到舰长一人，连副舰长都不知道。当参战部队一进入单冠湾，海防部队就立即切断择捉岛与外界的一切联系，连岛上居民的粮食等生活必需品都由海军的补给舰连运送，对参战官兵的私人信件一律进行检查，并一直扣押到开战那天再发出。参战部队的舰载机前脚刚一离开九州训练基地，其他部队的飞机后脚就进驻，照常进行训练，以造成舰载机部队还在九州训练的假象。部队向珍珠港开进途中严格保密，11月18日，参战的先遣部队27艘潜艇分别从佐伯湾和横须贺出发，伪装成日常巡逻，白天潜航以免被发现，夜晚才浮出水面以水面状态航行。11月26日，水面舰艇组成的突击编队从单冠湾起航，沿风大浪急很少有船只走的北航线，以3艘潜艇在队列前200海里进行侦察，整个编队实施二十四小时的严密对潜、对空警戒，同时采取严格的无线电管制，只收不发，密切注意日美谈判进程和有关的开战指令。同一时间里，日本海军更改了密码和无线电呼号，在九州的舰艇部队和航空兵频繁进行无线电联络，还特别用数艘驱逐舰伪装航空母舰进行无线电通信，以干扰欺骗美军的无线电监听。
正是这些措施，使日军的偷袭行动大获成功，以32架飞机（其中3架在起飞和返航中坠海，另29架在战斗中被击落）、1艘大型潜艇、5艘袖珍潜艇的损失，阵亡飞行员55人、潜艇艇员77人，被俘艇员1人，总共损失133人的代价，击沉美军4艘战列舰、1艘布雷舰、1艘靶船，重创1艘战列舰、3艘巡洋舰、3艘驱逐舰，击伤3艘战列舰、3艘巡洋舰、5艘辅助船，击毁飞机260架，击伤飞机63架，毙伤美军4594人（其中死2337人，伤1341人，失踪916人）的辉煌胜利。
美军遭到如此惨重的损失，其原因很多军事家、历史家都作过概括，主要有：政治上长期执行绥靖政策，麻痹了自己军民，导致戒备松懈；军事思想上墨守陈规，没有认识到武器装备发展所带来的作战方式的巨大变革，认为珍珠港远离日本3500海里，在日军有效打击范围之外；战略上高估自己的力量，低估了日军的实力，认为即使日本发动战争，也没有能力长途奔袭，最多袭击东南亚地区。
五十年来随着时间的推移，英美一些秘密档案逐步解密，使人们逐渐认识到珍珠港惨败的真正原因：这是一出苦肉计！以美国总统罗斯福为首的少数富有远见的政治家深深明白，如果美国不及时参战援助正在艰苦困境之中的英、中、苏等反法西斯国家，等到德、意、日轴心国打败了英、中、苏，确实控制了欧亚大陆后，势必会进攻美国，那时势单力孤的美国将无力对抗根基扎实的轴心国，所以早参战比晚参战有利，但美国国内孤立主力思想非常严重，上到国会议员，下到平民百姓，都反对加入战争，使得罗斯福总统很多援助计划都受到掣肘，甚至连发表谴责日本侵略中国的声明都遭到指责！所以罗斯福不惜牺牲珍珠港，来唤起民众的觉醒。——12月8日，罗斯福在国会发表参战演讲和战争咨文，参议院全票通过，众议院仅一票反对，美国的适龄青年在征兵站前排起长队踊跃报名参军，孤立主义在一夜之间烟消云散。