11所是原来的总体设计部，按照专业下有总体室、结构室、遥测室、弹头室、伺服机构室、设计保障室等11个室。
“按照型号分最多时有5个总体室，每个总体室负责一个型号。从1969年到1974年，逐步撤销总体室，后来变成2个总体室。”李法瑞详细解释。
随着国防部五院改为七机部，相关单位完成集体转业。“正式脱军装是1965年6月1号。5月31号之前可以穿军装，6月1号以后就不能穿军装了。”李法瑞说。
1965年，国防部五院四分院改称七机部第四研究院，并从四川泸州搬迁到内蒙古自治区呼和浩特。1978年起，这个单位先后改称内蒙古自治区第七工业局、七机部第四研究院驻内蒙古指挥部。
1999年7月，国防科技工业十大集团公司成立，“内蒙古基地”改为中国航天科工集团第六研究院。
“航天四院”，名称为“航天动力技术研究院”。它始建于1962年7月1日，是中国规模最大、实力最强的固体火箭发动机基础理论研究、设计、研制、生产和各种试验基地。
1968年2月20日，经毛泽东批准，成立中国空间技术研究院，即第七机械工业部第五研究院，亦称“七机部五院”。
作为中国空间技术的主要研究中心和航天器研制、生产基地，它的主要任务是：参与制定国家空间技术发展规划，研究、探索和开发利用外层空间的技术途径，承接用户需求的各类航天器和地面设备的研制及提供优良的服务，空间技术成果的推广应用，以及空间技术对外交流技术与合作。
老专业基础上分出来的新院
其后七机部又经历了航天工业部、航空航天工业部及中国航空工业总公司和中国航天工业总公司（国家航天局）的历史沿革，直至1999年，组建成立了现在的中国航天科技集团、中国航天科工集团。
李法瑞介绍，后来的六院、七院、九院、十一院等都是专业调整后设立的。
现在位于西安的“六院”是最初在秦岭山区的“067基地”，创建于1965年，在1981年命名为“六院”，是中国液体火箭发动机研制中心和专业抓总单位，承担着为中国运载火箭和导弹武器提供液体火箭发动机的重任。“是把中国航天科技集团中和发动机有关的研究所集中在一起，成立的发动机动力装置研究院。”现在名称为“航天推进技术研究院”。
“七院”是四川的“062基地”。早期在川北地区五六个主要搞生产的工厂后来搬到成都，和四川地区的工厂、研究所合并后，成为现在的“七院”，即“四川航天技术研究院”。
“八院”是之前的上海航天局，现在隶属于中国航天科技集团公司，名称为“上海航天技术研究院”，始创于1961年8月，最早称为上海机电二局。“既研究火箭，也研究卫星。”
“九院”是中国航天科技集团把几个搞电子元器件的机构合并在一起成立的。院址也在北京，叫“中国航天电子技术研究院”。
“十院”现在空缺。
“十一院”是在最早的空气动力研究室的基础上发展而成的研究所，后来变成“中国航天空气动力技术研究院”。
李占奎总结，中国航天科技集团下辖一院、四院、五院、六院（西安）、七院、八院、九院、十一院，等等。中国航天科工集团下辖二院、三院，以及“老四院”在内蒙古呼和浩特的部分，现称为“航天科工六院”，另外，还有搞基建的“航天科工七院”，等等。
这些默默运行的机构，最终支撑着“神舟”和“嫦娥”的飞天之旅。