据长春市文物志等文献记载，日本关东军第100部队于1939年建成。这支部队名义上以动物防疫等为主要职能，实际上则是一个“细菌武器工厂”，专门用于培训从事细菌战的人员，为日军进行细菌战服务。
当时，100部队拥有大约600至800名工作人员，包括细菌专家、化学专家、兽医专家等。为了掩人耳目，该部队对外称为“关东军马匹防疫部”，“100部队”只是为了掩饰其从事秘密活动的代称。
在这个看似普通的院落周围，曾经占地十多万平方米，有着非常壮观的地上和地下建筑设施。据文献记载，100部队的营区曾经有数十幢楼房，每幢建筑之间相隔二三十米。建筑包括地上和地下两部分，地下室和一楼都是实验室，其中还有实验室与囚室相连。
除了办公场所和实验场所外，100部队里还有大量牲畜饲养场，里面养着大到马匹、小到老鼠等实验动物。
100部队旧址内多栋巨大的棚舍如今已经踪迹皆无。据了解，这些非常壮观的棚舍内曾饲养大量用于实验的马、牛、羊、鼠等动物。据研究人员推算，当时每年可能有万余匹马以及数万只各类动物等用于实验，其中不少动物为日军掠夺而来。
遗址曾挖出巨大尸坑
历史研究专家表示，100部队当时的任务与731部队基本相同，主要从事细菌武器的研制工作，并培养大批细菌专业人员。100部队主要侧重于研究用细菌污染牧场、水池等场所，在牲畜间制造传染疫病，同时也研制人畜并用的细菌武器，这其中包括鼻疽菌、牛瘟菌、鼠疫等。
据档案资料显示，100部队利用老鼠进行细菌战的各项实验，用狗培植狂犬病菌，用马研究炭疽和鼻疽，用牛羊猪分别制造牛瘟、羊瘟和猪瘟，用鸽子进行病菌传染……然后疯狂地将这些病菌投放到无辜的居民区，对受害地区人民的生命财产造成了无法估量的伤害和损失。