2001年，市委、市政府提出发展无公害农产品的战略决策。王刚云带领技术人员开展调研论证，制定了《商洛市无公害蔬菜实施方案》，并在商州抓千亩无公害蔬菜示范园，坚持深入示范区培训指导，每周一次，风雨无阻。为了使菜农掌握黄瓜霜霉病、灰霉病的正确识别方法和黄板诱杀技术，年过半百的他在闷热的大棚中边操作边讲解，往往一干就是一晌，闷热的大棚里蒸得人汗流浃背，但群众不掌握技术，他便一遍一遍做示范。在他的努力下，我市相继引进示范推广高效低残留农药40多种，示范推广物理诱杀技术、无公害栽培管理技术，农药残毒检测监管技术等取得了显著成效。2008年，全省百万亩设施蔬菜工程启动，王刚云带领站上技术人员，在商州区大荆镇孟村建立设施蔬菜基地示范200多亩，采取物理防治、生物防治等病虫害绿色防控技术，取得了显著的成效。截至目前，以带动全市开发无公害农产品面积260万亩，认定无公害生产基地162个，认证无公害农产品133个，使农药残毒超标率由2001年的23%下降到现在的4.6%，促进了本市无公害、绿色、有机农产品突破发展。
中药材生产是商洛的支柱产业，但随着种植面积的不断扩大和种植年限的延长，药材病虫害已成为制约其发展的瓶颈。对此2006-2008年王刚云同志主持组织实施了《商洛市五大商药主要病虫害绿色防控技术与推广》项目。他带领技术人员深入各县区开展了大量的调查和试验研究，摸清了五大商药主要病虫害种类及发生规律，总结集成了中药材主要病虫害绿色防控技术，并在七县区大面积示范推广。三年来累计推广57.8万亩，新增总产值10963.74万元，取得了显著的经济、社会和生态效益。
情系“三农”，为民排忧解难是他的情怀，默默奉献、兢兢业业是他的作风，开拓创新推广植保技术，为商洛农业发展保驾护航是他不懈的追求。