奏折档案是最直接的原始史料，存档后难以面世。北京故宫午门东侧文华殿南的内阁大库内档是它的藏身之所，包括皇帝诏令、臣僚奏折、朱批谕旨、实录、圣训、会典、起居注、以及殿试考卷等，内也夹杂宋元刻本残书等，汗牛充栋。近代流失严重，如清末内阁大库失修后遭水淹，光绪25年一次清查霉烂就销毁4500捆库存文件，另一部分则被人为盗卖后移出宫外，成为国家图书馆、北京大学收藏的主要来源，其中经由1916年历史博物馆筹备处挑选出较完整的存于故宫午门之上的62箱，1502袋，后来历经北京大学整理，直至1930年由故宫博物院接收。
1922年北洋曹琨贿选，政府财政吃紧，教育部、历史博物馆筹备处连职员工资都发不出， 经当时的教育部同意，历史博物馆筹备处以废纸名义出卖存放于故宫午门外朝房内的明永乐至万历年间的档案，约十几万斤，售价3000大洋，这批珍贵的明代档案至此无影无踪。同年，再次出售历史博物馆存放于端门及朝房里的档案，包括清顺治到宣统年间的档案15万余斤，装了8000麻袋，售价4050元大洋，这批档案少部分流散民间。
奏折的内容是决定收藏价格的最重要因素。现在有朱批的普通奏安折，价格价格已达2万元，内容比较特殊的，卖价就更高。
嘉德公司1996年4月春季邮品拍卖会上，拍了两件奏折，一件是乾隆三十八年(1774年)二月十八日为护理陕西巡抚毕沅给乾隆皇帝的奏折，主要报告陕西军事驿站分布情况。另一件是清光绪八年(1883年)三月十三日，宗室谦禧、永德上光绪皇帝奏折，主要请示蒙古和新疆等地驿站马匹津贴脚费情况，光绪皇帝圈点和朱批64字，成为研究新疆和蒙古驿站的重要史料。
在2006年的中国嘉德春拍中，有一件乾隆年“勘夷使进藏”奏折，由大学士鄂尔泰等上奏，内容为已勘查一条鲜为人知的由新疆经甘肃、青海进入西藏的驿站邮路，奏折后有乾隆皇帝御笔朱批“依议速行”，成交价达到9.02万元。（中国证券报）