由哥本哈根大学、深圳华大基因研究院等多家单位组成的研究团队，成功破译了约70万年前生活在加拿大地区的史前马的全基因组序列图谱，并利用该基因组信息阐释了马的进化历程，相关研究日前在《自然》杂志发表。这是迄今为止破译的最古老的基因组，比去年完成的丹尼索瓦人基因组还要古老10倍，这项研究为包括远古人类在内的诸多已灭绝物种的基因组图谱绘制，奠定了重要的遗传学基础。
2003年，一个研究团队在加拿大育空领地蓟溪遗址古老的永久冻土层，发现了冰封已久的马骨骼化石碎片。该马骨化石来自于一匹远古马的腿部，距今约有56万至78万年的历史。DNA会随着时间的推移而逐步降解，理论和经验证据均表明该马古化石的DNA已经接近保存的临界值。而且到目前为止，还没有11万至13万年以上的古DNA全基因组测序信息。然而通过初步的分析，该化石残存有一小部分胶原和血液。由此，研究人员决定重构该古马的遗传信息。
同时作为对照，研究人员还对一匹4.3万年前的马、5匹现代家养马品种、一只普氏野马和一只驴进行了全基因组测序。通过进一步的进化分析发现，现代马、驴和斑马最近的共同祖先存在的时间大约在400-450万年前，比过去认为的时间要向前推进了两倍，因此，它们有足够长的时间进化成现在的马属种群。
同时，研究人员还发现，在过去的200万年间，马属种群发生了多次波动，特别是在气候剧变时期，多个冰期使得草原面积扩张，马的数量经历了一系列起伏。研究人员推断，普氏野马和现代驯化马的种群分化大约是在3.8万至7.2万年前。同时，基因组学数据表明，普氏野马并未与现代驯化马进行杂交，这也支持了普氏野马确实是现存最后一种真正的野马这一观点。
此外，研究人员还发现了一些在马的进化中免疫系统和嗅觉系统受到不断选择的证据。最终，研究人员发现与普氏野马相比，在不同的现代家养马品种之间，鉴定出29个低水平的遗传变异区域，这些区域可能成为驯化的遗传标记。