清代《四库全书总目》对《锦绣万花谷》学术价值的评价应该是持平之论：“所录大抵琐屑丛碎、参错失伦，有乖体要，故颇为陈振孙所讥……特其中久经散佚之书颇赖此以存崖略。又每类后用《艺文类聚》例，附录诗篇，亦颇多逸章剩什，为他本所不载。略其烦芜，撷其精粹，未尝不足为考证之资也。”
近年来，《锦绣万花谷》的部分卷册不断被各种机构影印，《北京图书馆古籍珍本丛刊》、《续修四库全书》、《中华再造善本》、《日本藏中国珍本古籍》中都曾收录该书。版本学家江澄波认为，《锦绣万花谷》前有国家图书馆、北大图书馆、日本若干机构的藏本，后有争夺影印本，谈不上“古秘珍绝的国宝”。
“这次匡时拍卖的这部《锦绣万花谷》确实是全本，这点最难能可贵。它对学术研究最大的价值，在于我们可以借此研究《锦绣万花谷》本身编纂、刊印、传播的过程。”刘蔷告诉南方周末记者。
过云楼在当年是中小规模的藏书楼
刘蔷发现，自己当年在《顾氏过云楼及其藏书》一文中很多说法都被放大了N倍。她文中提到，顾家1951年捐献给上海市文管会的三百余件书画以及明代善本书、罕见稿本是上海文管会所藏书画的半壁江山。到了2012年4月，变成了顾家的捐献是“上海博物馆的半壁江山”。
另一个说法是此次拍卖的1/4过云楼藏书加南京图书馆已经收入的3/4,可使过云楼旧藏合成完璧。刘蔷认为这并不准确：“在2006年过云楼‘1/4藏书’现身嘉德拍卖会之前，‘江南六家藏书’等拍卖会也拍卖过一批过云楼的藏书。此外还有其它途径流散出去的，现在有些藏家手上有几十种过云楼藏书。”
版本学家江澄波印证了刘蔷的说法：“过云楼的藏书，在嘉德拍卖行介入前后，顾三公子已经陆续委托卖掉了不少。据我所知，就有顾千里批校明嘉靖本《仪礼》。嘉德公司的拓晓堂告诉我，顾家的书，每次拍卖都有。由此可见，匡时最近拍卖的这批书，已经是拓先生挑选之后的剩余之物，‘顾批黄跋，(顾千里、黄丕烈，皆是干嘉时期的版本大家。古籍界素有‘顾批’、‘黄跋’、‘鲍校’的说法，经过顾千里批注、黄丕烈写跋、鲍廷博校对的古籍格外珍贵)早不见踪迹。”
再一则充斥各种媒体报道的说法是，顾家书画给外人品鉴，古籍却秘不示人。版本学家傅增湘当年获准到过云楼看书，条件是“只能看，不能抄”。是傅增湘的《顾鹤逸藏书目》让过云楼藏书闻名天下，但这书目傅增湘是凭记忆默写的。这份辗转获得的书目似乎平添了过云楼藏书的珍贵。
“我不知道这种说法是怎么来的。”刘蔷说，据她了解的情况和推断，过云楼藏书应该是有草目的。“傅增湘的书目很明显是两种字体，是在一种笔体的目录上做了一些修改，比如某书书目原本说是宋本，修改后，在下面注：疑为元本。”
国家文物鉴定委员会委员、上海图书馆研究馆员陈先行与刘蔷的观点类似：“《顾鹤逸藏书目》目录题名之下注‘抄本’，又注‘傅沅叔先生藏本’，如果是傅先生缩编，应该不会如此著录，只能理解为这个抄本是傅先生所藏……顾氏原本有一个草目，傅先生是根据草目，在自己阅览期间，就所发现的问题，随手进行了校正。”
在刘蔷看来，顾家不是保守的家庭，但与书画可以跟同好一起欣赏不同，顾家收藏的古籍是为了教育子孙。顾家第一代藏书人顾文彬曾说过，希望家藏旧钞能“益吾世世子孙之学”。
因此顾家藏书非常重视吴中地区的乡邦文献；经史子集四部齐备，但并不强调正经正史，可见顾家藏书并不特为博取科举功名；因为本家族多出诗人、画家，顾家藏书中有不少与书画金石鉴赏有关。