因为阿里地区人民医院各种人才都很匮乏，血站当时也刚刚建立，而王乾慧在商洛刚毕业的时候就在输血科工作，后来才到生化室，有着丰富的输血科工作经验，就响应阿里地区人民医院领导的指示，着手筹建输血科。
他按照二甲医院输血科的评审要求，制定输血管理文件，制定输血反应处理规范和应急用血预案，开展血液质量管理的方案，建立有输血过程的质量管理监控，落实输血相容性检测的管理制度，建立输血不良反应预案，开展抗人球蛋白实验新项目，并且给全院医务人员进行关于临床输血内容的业务讲座。
在这段紧锣密鼓的创“二甲”日子里，王乾慧完全把自己融入到了所经手的工作里。在检验科，他依然值二线班，有人发现的有异常值的不敢报的审查报告，他严格审核报告，并耐心给发现者讲解原理。在输血科，他担任负责人，白天黑夜随叫随到，先后4次为抢救危重患者深夜进行交叉配血。
王乾慧说，这期间比较突出的问题是阿里地区人民医院没有自来水，所以只能上班时间一直戴手套。尽管如此，还是被医院经常无偿为危重病人献血的藏族医生和家属所感动。他在自己后来的工作总结里这么写道：“自从踏上阿里这片土地，就深深地爱上了这片神奇而美丽的雪域高原，这里不仅山好水好，还有那么多纯洁朴实、和蔼可亲的藏族同胞。在这里，远离了故土，我却依然感受到了家的温暖。”
王乾慧回到商洛之后，阿里地区人民医院的输血科交给了铜川去的一位援藏医生。因为这名医生没有临床经验，遇到各种标本不清、标本凝块等问题，依然微信请王乾慧解答。
通过陕西省两批“组团式”援藏医疗队帮扶指导，阿里地区人民医院在综合管理、业务发展、医疗服务能力提升、内涵建设等方面有了很大提高。今年8月18日，阿里地区人民医院通过了自治区卫生计生委专家组的评估验收，正式成为二级甲等医院。
家的温暖
王乾慧的谈话中，一直在重复提及藏族同胞淳朴的天性，说他们如何单纯善良，不争名夺利。有一次他去一位退休的行署副专员家里做客，却发现相对昂贵的只有电视、冰箱、电脑和藏式家具。而这种从上到下都不攀比的好的氛围，普遍与信仰佛教相关。几乎每家都有一个僧人，而家庭的收入90%捐赠给寺庙，剩下的10%也大部分花在吃饭上。他们不吃鱼和猪肉，勤劳的人会花大量时间自制酥油茶和藏粑，懒散的就直接吃牦牛肉和羊肉。藏民基本安居乐业，对援藏干部心存感激。他们听得懂汉语，路遇汉人会主动站起来微笑并递上自己的茶。
首批“组团式”援藏队伍到达阿里之后，阿里地区人民医院的门诊量和手术量提高了50%，妇产科再无死亡率。而抵藏的第一天，以咸阳一位颅外专家为首的5名医生就成功完成了阿里死亡率较高的开颅手术。阿里地区人民医院的院长和书记都非常感激，经常自掏腰包，请王乾慧等援藏医生去家里做客，增加猪肉菜肴，取出几十年珍藏的好酒。藏族患者在化验的时候遇到疑难问题，也经常主动打电话找王乾慧请教。
王乾慧的家人远在商洛，但藏民们和他打成了一片，成了他的另一拨“家人”。好几次王乾慧路遇藏民玩耍，藏民主动将阿里随处可见、内地却极为稀有的石头当礼物送给王乾慧。王乾慧也宁愿被高原上的太阳晒出几个月都消不掉的比烧伤还严重的泡，也要跟随医疗队去下乡义诊，和藏民载歌载舞去孤儿院捐款。
王乾慧说：“藏民守边疆、天性淳朴，不知为什么，看到他们就想奉献。”