9月17日至18日，王立军涉嫌徇私枉法、叛逃、滥用职权、受贿案在四川省成都市中级人民法院第一法庭依法开庭审理，法庭宣布择期宣判。
根据记者旁听法庭公开审理情况、媒体通气会和办案机关介绍，王立军案件的全过程和关键点逐渐明晰。
徇私枉法
包庇涉嫌故意杀人的薄谷开来
薄谷开来及其子薄某某与尼尔·伍德因经济利益发生矛盾，薄谷开来认为尼尔·伍德威胁到其子人身安全。
2011年11月12日，经与薄谷开来等人商议，王立军以尼尔·伍德涉嫌毒品犯罪为由，安排对其实施监控。
11月13日晚，薄谷开来、张晓军（重庆市委办公厅原工作人员、薄谷开来家中勤务人员，已判刑）在重庆市南山丽景度假酒店将尼尔·伍德投毒杀害。当晚12时许，王立军与薄谷开来通电话，得知其在酒店与尼尔·伍德见面、喝酒等情况。
11月14日中午，薄谷开来在自己住处当面向王立军讲述了其投毒杀害尼尔·伍德的具体经过，王立军进行了秘密录音。
薄谷开来在证词中说：“11月14日中午，王立军来到‘三号楼’（薄谷开来住处），当天见到王立军以后，我详细告诉了他13号晚上我去见尼尔及实施投毒的过程。他让我不要再去想这件事，今后这事和我无关了，还让我把案件的记忆抹去。我讲我有点担心，他讲过一两个星期就好了。”
公诉人当庭出示的录音材料显示：该音频资料的对话人为王立军和薄谷开来，其谈话内容为薄谷开来将毒杀尼尔·伍德的详细过程告知王立军。
11月15日，尼尔·伍德被发现死亡后，王立军指派与薄谷开来关系较近的重庆市公安局原副局长郭维国（已判刑）负责该案的办理，但没有向郭维国等办案人员告知其所掌握的薄谷开来涉嫌杀害尼尔·伍德并有录音证据的事实。
11月16日上午，郭维国、李阳（重庆市公安局刑警总队原总队长，已判刑）、王鹏飞（重庆市公安局技术侦察总队原总队长、渝北区公安分局原局长，已判刑）、王智（重庆市公安局沙坪坝区公安分局原常务副局长，已判刑）做出尼尔·伍德系酒后猝死的结论，王立军未提出异议。
11月17日，王立军主动将郭维国等人现场提取的记录薄谷开来到过现场的酒店监控录像硬盘交给薄谷开来。
11月18日，尼尔·伍德尸体在当地火化。当晚，王立军将该情况电话告知薄谷开来。张晓军在证言中称：“2011年11月18日晚上，王立军给我打电话让薄谷开来来接，薄谷开来接过后说，王立军来电话说了8个字‘化作青烟，驾鹤西去’。”
面对涉嫌故意杀人这样的重案，王立军知情后为何不仅不依法履职，反而故意包庇薄谷开来不受立案侦查？
王立军在供述中称：“到重庆以后，我就经常去薄谷开来家。我觉得薄谷开来对我挺不错的。”“我明知该案如果他杀成立，会是重大案件，但为了不得罪薄谷开来，我回避了这个案件。”“说句实话，这个案件如果不是牵涉到薄谷开来，我肯定会安排多管齐下，早就把这个案件查清了。”
公诉人指出，一系列证据证实：王立军明知薄谷开来涉嫌故意杀人却故意包庇，不去追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
矛盾产生
向时任重庆市委负责人反映遭打耳光
虽然王立军与薄谷开来关系密切，但并不意味着没有矛盾。证据显示，“11·15”案案发前，王立军和薄谷开来就因为种种原因产生过矛盾。
2011年8月12日，薄谷开来之子薄某某有事想见王立军，王立军人在重庆市区但不想见他，就让司机说自己在万州，结果薄某某在夜赴万州的路上差点出了车祸，薄谷开来因此对王立军很生气。